Programme EQUIPES FRM : 20 ans de publications scientifiques

La Fondation pour la Recherche Médicale (FRM) célèbre les 20 ans de son appel à projets « Équipes FRM », devenu depuis une référence incontournable pour la communauté scientifique française. En 20 ans, ce sont 843 projets en biologie-santé issus de 625 équipes différentes qui ont pu être soutenus et qui sont à l’origine d’innombrables retombées scientifiques et d’un corpus de publications conséquent. Pour l’occasion, nous vous proposons un ensemble de chiffres-clés et d’infographies qui explorent ces 20 ans de publications scientifiques.

Programme de soutien d’envergure de la Fondation pour la Recherche Médicale, le programme EQUIPES le programme EQUIPES FRM est remarquable d'un point de vue nombre de résultats originaux issus des projets ayant fait l’objet d’une publication scientifique. Depuis 2005 et le lancement du premier appel à projets « EQUIPES FRM », ce sont 5 873 publications scientifiques qui ont été publiées. Depuis 2020, entre 500 et 600 publications paraissent chaque année, représentant en moyenne 40% de l’ensemble des publications issues des projets soutenus par la FRM, tous programmes confondus. La diffusion et la reprise des résultats est tout aussi remarquable avec un quart des publications issues des projets présentes parmi le top 10 % mondial des publications les plus citées dans leur domaine.

Equipes FRM : une riche collaboration internationale 

L’exercice de la fabrique de la science est le fruit de collaborations entre chercheur·ses à l’échelle d’un territoire, d’un pays ou de plusieurs continents. Cette forte dimension collaborative peut être appréciée à travers les publications du corpus EQUIPES FRM avec plus de 30 000 auteurs et autrices différents, provenant de plus de 95 pays à travers 5 continents.

Le pays associé à une publication est basé sur l’affiliation(s) des auteur·rice(s).

Les Etats-Unis représentent le premier partenaire collaboratif au sein des publications issues des projets EQUIPES FRM, avec 20 % des publications présentant au moins un·e auteur·rice possédant une affiliation associée à une adresse aux Etats-Unis. Arrivent ensuite l’Allemagne (11 %), la Grande-Bretagne (10 %), la Suisse (5,4 %) et l’Italie (5,1 %). La Chine, qui est devenue le premier producteur mondial de publications scientifiques, n’est que le 13^e partenaire collaboratif au sein des publications EQUIPES FRM, avec 130 publications associées entre 2005 et 2025. 

Au-delà des collaborations internationales, les réseaux de collaborations spécifiques construits autour de publications et des projets de recherche peuvent être appréciés plus finement en analysant les collaborations à l’échelle des auteurs et autrices.

Collaborations des co-auteurs et co-autrices des publications EQUIPES FRM parues entre 2005 et 2025. 

Les auteurs et autrices sont classés selon leur fréquence et sont associés selon leur co-occurrence. La taille des éléments est représentative de la fréquence de l’auteur·rice parmi les publications sélectionnées, et l’épaisseur des liens est proportionnelle au nombre de co-occurrence entre les éléments liés. Les communautés de mots-clés fréquemment associés sont colorées par différentes couleurs. Résolution de détection des communautés : 0,1

Explorer la carte dynamique 

Le dense réseau de collaboration visible dans le coin inférieur droit, que l’on pourrait qualifier comme notre « grande tache de Jupiter » représente ici les co-auteurs et co-autrices les plus fréquemment associé·es aux publications issues du projet de recherche de Jean-Laurent Casanova (EQUIPE FRM 2019). Une forte co-spatialisation est observée avec le réseau de co-auteur·rices, ici représenté en jaune, associé·es aux publications impliquant Olivier Schwartz (EQUIPE FRM 2020). Ce rapprochement spatial est la résultante de plusieurs co-auteurs et co-autrices partagés au sein de 3 publications communes, produites en collaboration avec JL Casanova.

D’autres collaborations entre équipes de recherche lauréates peuvent également être repérées comme le cluster associant Vincent Prévot (EQUIPE FRM 2005 et 2013) et Ralphf Jockers (EQUIPE FRM 2013 et 2019) ayant abouti à la production de 7 publications communes, en lien avec leurs financements FRM.

Les deux exemples cités ne sont qu’une infime part de la multitude de liens collaboratifs représentés et nous vous invitons à explorer cette carte plus en détails via la carte dynamique disponible en ligne. 

Les concepts en biologie-santé vus par 20 ans d’équipes FRM

La richesse du corpus bibliographique issu des projets EQUIPES FRM de ces 20 dernières années permet de concevoir une carte des concepts scientifiques associés aux projets. Face au temps long de la science et à l’émergence de nouveaux concepts et thématiques de recherches opérant sur plusieurs années, notons que le cadre d’analyse à l’échelle d’un seul programme d’appel à projet se veut néanmoins plus contraint qu’un corpus thématique ou plus global.

Prenons l’exemple d’un concept général, présent sur plusieurs années entre 2005 et 2025 et l’évolution des sous-concepts qui lui sont associés au cours du temps.

Le mot-clé auteur « inflammation », logiquement associé aux concepts et thématiques liés aux systèmes immunitaires et aux médiateurs de l’inflammation, apparaît au sein du corpus à partir de 2012 et devient un des mots-clés les plus fréquemment représentés dans les publications à partir de 2015. Entre 2012 et 2015, les publications portant sur l’inflammation sont fréquemment associées aux notions liées aux cellules souches, à l’ischémie et à l’angiogenèse, et à des sous-concepts, dont la co-fréquence est plus faible, portant sur la neuro-inflammation, le système nerveux central, ou encore des pathologies comme l’obésité ou la maladie d’Alzheimer. 

Une évolution importante des sous-concepts fréquemment associés à l’inflammation est observable pour les publications parues entre 2016 et 2020. Les notions d’autophagie et de fibrose ont une forte co-occurrence avec le terme inflammation tout en étant elles même fortement associées au sein de travaux portant sur le carcinome hépatocellulaire. Le concept d’inflammation est abordé également parmi plusieurs publications qui se concentrent sur des pathologies du foie comme la stéatose hépatite non alcoolique (NASH et NAFLD), en particulier avec le diabète de type 2. 

On peut aussi noter l’association inflammation – dysfonction endothéliale en lien avec des travaux portant sur l’athérosclérose, ou portant sur l’hypertension pulmonaire et le remodelage vasculaire. 

Apparaissant pour la première fois au sein du corpus, les sous-concepts du microbiote intestinal ou de l’optogénétique sont également associés à des travaux faisant appel à la notion d’inflammation. 

On retrouve parmi les publications parues entre 2021 et 2025 un certain nombre des sous-concepts associés au terme inflammation observés dans les corpus antérieurs. L’obésité est encore associée aux notions portant sur le diabète, mais on note également la représentation d’une co-occurrence solide en lien avec l’hypothalamus et la balance énergétique.  Les travaux portant sur le microbiote intestinal évoluent également et se précisent autour de la dysbiose, la notion de quorum-sensing, la barrière intestinale et les maladies inflammatoire chroniques de l’intestin.

Réseau de co-occurrences des « mots-clés auteurs et autrices » associés au terme inflammation.  

A : Corpus 2011-2015. B : Corpus 2016-2020. C : Corpus 2021-2025

Les mots-clés auteur·rices sont classés selon leur fréquence et sont associés selon leur co-occurrence. La taille des termes est représentative de la fréquence du terme parmi les publications sélectionnées. Les communautés de mots-clés fréquemment associés sont colorées par différentes couleurs.  Résolution de détection des communautés : 0,3

Les concepts associés au Covid-19 sont de ceux qui émergent en lien avec l’inflammation. Le réalignement de la recherche mondiale au profit de la compréhension du virus SARS-CoV-2 et des effets de la Covid-19 se matérialise ainsi de façon remarquable au sein du corpus de publications issues des projets EQUIPES FRM. L’analyse de la fréquence et de la co-occurrence des « mots-clés auteurs » associés aux publications par tranche de 5 ans indique que les termes « Covid-19 » ou « SARS-CoV-2 » sont presque inexistants dans les publications parues entre 2016 et 2020 et issues des projets EQUIPES FRM, tandis qu’ils deviennent dominants à partir de 2021. Les termes se retrouvent associés aux thématiques liées aux mécanismes et composants de l’immunité et de l’inflammation.

Réseau de co-occurrences des « mots-clés auteurs et autrices » associés aux termes « Covid-19 » et « Sars-CoV-2 » des publications parues entre 2021 et 2025.

Les mots-clés auteur·rices sont classés selon leur fréquence et sont associés selon leur co-occurrence. La taille des termes est représentative de la fréquence du terme parmi les publications sélectionnées. Les communautés de mots-clés fréquemment associés sont colorées par différentes couleurs.  Résolution de détection des communautés : 0,3

Autre exemple de concept au sein du corpus de publications EQUIPES FRM en phase avec les thématiques émergentes en biologie-santé : celui-lié aux organoïdes. A l’échelle des publications mondiales, la fréquence de travaux abordant ce concept se maintient à un niveau très faible jusqu’en 2015. A partir de 2015, la fréquence par an suit une croissance très soutenue et se voit multipliée par 10 entre 2015 et 2021 (données OpenAlex). 

Inexistant parmi les mots-clés auteurs et autrices des publications EQUIPES FRM avant 2021, le terme apparait pour la première fois dans les travaux issus des projets en lien avec les concepts liés à l’embryogénèse ou de pathologies du foie (NASH et NAFLD).

Réseau de co-occurrences des « mots-clés auteurs et autrices » associé au terme organoïde des publications parues entre 2021 et 2025.

Les mots-clés auteur·rices sont classés selon leur fréquence et sont associés selon leur co-occurrence. La taille des termes est représentative de la fréquence du terme parmi les publications sélectionnées. Les communautés de mots-clés fréquemment associés sont colorées par différentes couleurs.  Résolution de détection des communautés : 0,3

Les quelques exemples présentés dans cet article ne représentent qu’une part infime de la richesse du corpus de publications issues de deux décennies de recherche, et dont nous voulions vous présenter un aperçu pour l’occasion des 20 ans du programme EQUIPES FRM. L’ensemble des infographies sont disponibles dans le dossier mis à votre disposition, à partir duquel vous pourrez accéder aux figures dynamiques et aux cartes en haute-résolution.

Consulter l’ensemble des infographies et accéder aux figures en hautes-résolution ou dynamiques. Dossier_20ans_EQUIPE_FRM.pdf

Dans les années à venir, la production scientifique issue des projets EQUIPES FRM reflètera probablement les changements qui s’opèrent dans l’écosystème de la recherche et la fabrique des connaissances.

Le mouvement de la science ouverte, intégré depuis 2024 dans les recommandations des appels à projets de la FRM, pourrait contribuer à intensifier les co-citations¹ et les collaborations. L’ouverture des données et métadonnées² de la recherche permettra de rattacher de manière plus globale les publications scientifiques aux multiples autres produits de recherche, ce qui contribuera à apprécier plus finement la structuration de la production scientifique et ses retombées.

D’un autre côté, la production scientifique exponentielle observée ces dix dernières années³ amène certaines voix à se demander si, par la course au nombre de publications, le système de l’édition académique ne risque pas la surchauffe⁴, nécessitant une reconfiguration dans les années à venir. C’est le sens des initiatives de réforme de l’évaluation scientifique et de mesure de la science, dans lesquelles la FRM est engagée, qui appellent à ne plus regarder la science uniquement par le prisme du nombre de publications, à l’origine d’une forte pression sur les chercheurs et chercheuses. Si la richesse du corpus issus des projets EQUIPES FRM reflète le succès du programme, sa qualité ne peut pas être définie que par le nombre de publications produites. Les collaborations, les interconnexions et les évolutions qui structurent la production scientifique sont autant de dimensions supplémentaires que nous avons souhaité illustrer à travers cet article.

Ces éléments, la manière dont les chercheurs et chercheuses collaborent et le choix des thématiques scientifiques étudiées, se retrouvent justement sous le coup du virage politique qui est mené actuellement aux Etats-Unis. Une politique ouvertement opposée à la science et à son fonctionnement. Alors que les Etats-Unis sont le premier partenaire scientifique des équipes soutenues par le programme EQUIPES FRM, et des chercheurs et chercheuses français en général, la politique agressive américaine et son effet d’entrainement pourraient entrainer des répercussions globales et conduire à des évolutions notables à moyen et long terme dans la fabrique de la science.

1. Giovanni Colavizza, Lauren Cadwallader, Iain Hrynaszkiewicz(2025). An analysis of the effects of open science indicators on citations in the French Open Science Monitor. arXiv :2508.20747. https://doi.org/10.48550/arXiv.2508.20747 (preprint)
2. Barcelona Declaration on Open Research Information, Kramer, B., Neylon, C., & Waltman, L. (2024). Barcelona Declaration on Open Research Information (1.0). Zenodo. https://doi.org/10.5281/zenodo.10958522
3. Mark A. Hanson, Pablo Gómez Barreiro, Paolo Crosetto, Dan Brockington; The strain on scientific publishing. Quantitative Science Studies 2024; 5 (4): 823–843. doi: https://doi.org/10.1162/qss_a_00327
4. « L’inflation du nombre de publications scientifiques interroge », Le Monde, 12 novembre 2024

Sources des données : Compte-rendu scientifique des projets, OpenAlex, Web of Science 

Texte, analyse et conception graphique : Nicolas EUGENIE, Responsable analyse et impact scientifique